Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad23aP54726 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad23aP54726 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms