Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HccsP53702 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HccsP53702 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HccsP53702 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HccsP53702 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HccsP53702 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HccsP53702 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HccsP53702 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HccsP53702 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HccsP53702 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HccsP53702 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HccsP53702 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HccsP53702 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HccsP53702 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HccsP53702 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HccsP53702 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HccsP53702 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HccsP53702 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HccsP53702 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms