Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux1P53564 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux1P53564 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cux1P53564 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cux1P53564 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms