Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efnb1P52795 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efnb1P52795 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms