Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp1P52624 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms