Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2e3P52483 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms