Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold1P52431 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold1P52431 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pold1P52431 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pold1P52431 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pold1P52431 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms