Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec1P51908 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms