Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XpcP51612 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XpcP51612 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XpcP51612 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XpcP51612 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XpcP51612 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XpcP51612 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XpcP51612 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XpcP51612 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XpcP51612 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XpcP51612 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XpcP51612 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XpcP51612 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms