Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnnt2P50752 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnt2P50752 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms