Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtbrP50284 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LtbrP50284 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LtbrP50284 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms