Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpreP49446 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PtpreP49446 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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