Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epb42P49222 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms