Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brca1P48754 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brca1P48754 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brca1P48754 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brca1P48754 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brca1P48754 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca1P48754 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca1P48754 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brca1P48754 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brca1P48754 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brca1P48754 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brca1P48754 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brca1P48754 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brca1P48754 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca1P48754 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brca1P48754 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca1P48754 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca1P48754 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca1P48754 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms