Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TbcaP48428 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TbcaP48428 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.1 ms