Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn3P48299 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Edn3P48299 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms