Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VdrP48281 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VdrP48281 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VdrP48281 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VdrP48281 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VdrP48281 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VdrP48281 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms