Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rplp1P47955 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms