Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stt3aP46978 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stt3aP46978 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stt3aP46978 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stt3aP46978 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stt3aP46978 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stt3aP46978 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stt3aP46978 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stt3aP46978 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stt3aP46978 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stt3aP46978 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms