Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zic1P46684 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zic1P46684 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms