Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab11bP46638 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms