Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms