Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Klf1P46099 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klf1P46099 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klf1P46099 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms