Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlx1P43345 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms