Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept1P42209 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sept1P42209 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sept1P42209 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms