Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Mmp9P41245 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Mmp9P41245 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Mmp9P41245 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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