Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtbP41155 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtbP41155 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LtbP41155 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LtbP41155 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LtbP41155 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms