Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox7P40646 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox7P40646 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox7P40646 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms