Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ThpoP40226 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ThpoP40226 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms