Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csf3rP40223 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms