Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TtlP38585 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TtlP38585 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TtlP38585 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TtlP38585 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtlP38585 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtlP38585 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtlP38585 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtlP38585 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TtlP38585 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TtlP38585 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtlP38585 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtlP38585 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms