Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprkP35822 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprkP35822 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprkP35822 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtprkP35822 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtprkP35822 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms