Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly6dP35459 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly6dP35459 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6dP35459 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms