Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Grin2aP35436 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Grin2aP35436 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms