Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd1P33215 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms