Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa11P31311 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms