Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxc10P31257 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc10P31257 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms