Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd28P31041 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd28P31041 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd28P31041 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd28P31041 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms