Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc1P29341 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc1P29341 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms