Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PtprmP28828 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprmP28828 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprmP28828 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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