Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NapbP28663 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NapbP28663 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NapbP28663 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NapbP28663 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NapbP28663 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NapbP28663 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NapbP28663 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NapbP28663 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NapbP28663 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NapbP28663 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NapbP28663 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NapbP28663 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NapbP28663 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NapbP28663 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms