Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Col2a1P28481 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col2a1P28481 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms