Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Aco1P28271 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Aco1P28271 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aco1P28271 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Aco1P28271 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aco1P28271 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aco1P28271 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aco1P28271 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aco1P28271 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aco1P28271 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms