Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb1P28230 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb1P28230 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms