Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenpbP27790 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CenpbP27790 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenpbP27790 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenpbP27790 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpbP27790 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenpbP27790 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms