Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd40lgP27548 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms