Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd1P25322 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms