Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdk11bP24788 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdk11bP24788 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk11bP24788 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms