Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd11P23813 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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