Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd12P23812 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd12P23812 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxd12P23812 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxd12P23812 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd12P23812 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd12P23812 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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